II Curso de Nivelamento em Bioinformática - Programa

1º Dia - Segunda-feira, 03/05 (Eric Aguiar / Fabiano Pais / Guilherme Oliveira / Roney Coimbra)

TEÓRICO:
8:00h – 8:30h: Abertura (Guilherme Oliveira / Roney Coimbra)
8:30 – 9:30h: Células procarióticas e eucarióticas (Fabiano Pais)
9:30 – 10:30h: Conceitos básicos de genética: herança mendeliana, dominância, recessividade e codominância, herança multifatorial, haplótipos, equilíbrio de Hardy & Weinberg (Fabiano Pais)
10:30 – 12:00h: Estrutura do DNA, replicação, transcrição e tradução (Fabiano Pais)
PRÁTICO:
14:00h – 17:00h: Instalação e Tutorial de sistema operacional Linux (Eric Aguiar)
 
2º Dia - Terça-feira, 04/05 (Adhemar Zerlotini / Fabiano Pais / Flávio Araújo / Roney Coimbra / Rosiane Pereira)
TEÓRICO:
8:00h – 9:00h: Métodos em Biologia Molecular: Clonagem, PCR, seqüenciamento SANGER, microarranjos, SAGE (Fabiano Pais)
9:00h – 10:00h: Métodos em Proteômica (Rosiane Pereira)
10:00h – 12:00h: Alinhamento de sequências / matrizes de substituição (Roney Coimbra)
PRÁTICO:
14:00h – 15:00h: Egene – Tutorial (Adhemar Zerlotini)
15:00h – 17:00h: Métodos para sequenciamento de nova geração (Flávio Araújo )
 
3º Dia - Quarta-feira, 05/05 (Adhemar Zerlotini / Roney Coimbra)
PRÁTICO:

8:00h – 10:00h: “System de Novo Assembly Tools” – Tutorial (Adhemar Zerlotini)
TEÓRICO:
10:00h – 12:00h: Alinhamentos múltiplos / predição de genes (Roney Coimbra)
PRÁTICO:
14:00h – 17:00h: Blast – Instalação e tutorial (Adhemar Zerlotini)
 
4 º Dia - Quinta-feira, 06/05 (Adhemar Zerlotini / Laila Nahum / Roney Coimbra)
TEÓRICO:
8:00 – 10:00h: Estrutura e função de proteínas (Laila Nahum)
PRÁTICO:
10:00h -12:00h: InterproScan – Instalação e tutorial (Adhemar Zerlotini)
14:00h – 17:00h: Pacote EMBOSS – Tutorial (Roney Coimbra)
 
5 º Dia - Sexta-feira, 07/05 (Roney Coimbra)
TEÓRICO:
8:00h – 12:00h: Medidas de similaridade e de distância / Métodos de agrupamento e de classificação / Avaliação de agrupamentos (Roney Coimbra)
PRÁTICO:
14:00h – 17:00h: Exercício de medidas de similaridade e distância e métodos de ligação para agrupamento hierárquico (Roney Coimbra)
 
6º Dia - Segunda-feira, 10/05 (Laila Nahum / Luiza F. Andrade / Rômulo Moraes)
TEÓRICO:
8:00h – 12:00h: Análise filogenética (Laila Nahum)
PRÁTICO:
14:00h - 15:00h: ClustalX, PHYLIP e FigTree – Instalação (Rômulo Moraes)
15:00h - 17:00h: PHYLIP e FigTree – Tutorial (Luiza F. Andrade)
                                    
7º Dia - Terça-feira, 11/05 (Eric Aguiar / Francislon Silva)
TEÓRICO:
8:00h – 10:00h: Bancos de dados relacionais (Francislon Silva)
PRÁTICO:
10:00h - 12:00h: MySQL e Dbvis – Tutorial (Eric Aguiar)
14:00h – 17:00h: Tutorial linguagem SQL (Francislon Silva)
 
8º Dia – Quarta-feira, 12/05 (Adhemar Zertolini / Francislon Silva / Luiza F. Andrade / Roney Coimbra)
PRÁTICO:
8:00h – 12:00h: GenePattern – Tutorial (Roney Coimbra)
TEÓRICO:
14:00h – 15:00h: Visualizadores de genomas (AdhemarZerlotini )
PRÁTICO:
15:00h – 16:00h: ARTEMIS – Tutorial (Luiza F. Andrade)
16:00 – 17:00h: Genome Browser – Tutorial (Francislon Silva)
 
9º Dia - Quinta-feira, 13/05 (Rômulo Moraes)
TEÓRICO:
8:00h - 12:00h: Imunoinformática (predição de antígenos em células B e T) (Rômulo Moraes)
PRÁTICO:
14:00h – 17:00h: Softwares para imunoinformática em escala genômica - Tutorial (Rômulo Moraes)
 
10º Dia - Sexta-feira, 14/05 (Anderson Dominitini / Guilherme Oliveira / Leandro JacquesMarcos Vinícios B. da Silva / Mariana Simões / Roney Coimbra)
TEÓRICO:
8:00h –10:00h: Projeto de rede, serviços web e segurança do CEBio (Leandro Jacques)
10:00h – 12:00h: Projeto físico e lógico da infraestrutura do CEBio (Anderson Dominitini)
14:00h – 16:00h: Genotipagem (Marcos Vinícios B. da Silva)
16:00h – 17:00h: miRNAs e silenciamento gênico (Mariana Simões)
17:00h – Encerramento (Guilherme Oliveira / Roney Coimbra)